Lors de la dernière phase de la Ligue des Champions, l'Atlético de Madrid a été une fois de plus le protagoniste d'une polémique qui a ébranlé les supporters rouges et blancs : l'annulation d'un but du VAR. L'incident s'est produit lors du match contre Manchester United, lorsque l'attaquant américain Johnny Cardoso a marqué son premier but de la saison avant de le voir retiré par l'arbitre juste avant la mi-temps suite à un examen vidéo de l'arbitre. La décision était basée sur le fait que Marcos Llorente avait déjà reçu une main avant le rebond qui a permis la passe décisive qui a abouti au tir de Cardoso.
Le cas n'est pas isolé. Selon l'analyste Alexis Martín, l'Atlético est la deuxième équipe avec le plus de buts refusés par le VAR depuis l'introduction de la technologie en Ligue des Champions. Seul le PSG surpasse le club madrilène avec neuf buts refusés, tandis que le Bayern en compte huit, soit l'Atlético. Manchester City et le Real Madrid partagent la cinquième position avec sept buts chacun. En revanche, c'est Barcelone qui en a le plus profité, avec onze buts refusés contre ses rivaux, suivi du Bayern et du Sporting de Portugal avec sept chacun, et des Swiss Young Boys avec six.
La liste des buts refusés contre l'Atlético en Ligue des Champions remonte à la saison 2018-19, lorsqu'un match contre la Juventus a vu Álvaro Morata marquer après une faute de Chiellini qui lui a donné un avantage indu. La saison suivante, le but de Luis Suárez contre Liverpool a été refusé pour hors-jeu positionnel, et en 2020-21, la même erreur de hors-jeu s'est produite contre le Lokomotiv Moscou. En 2021-22, Antoine Griezmann a vu son but contre Porto annulé en raison d'une main involontaire avant le tir, et le 22-23, le but de Koke contre Porto a été refusé pour hors-jeu. Au cours de la saison 2023-24, le but de Samu Lino contre la Lazio et celui de Morata contre l'Inter Milan ont également été refusés pour hors-jeu et fautes antérieures, respectivement.
Le système de refus de buts a généré un débat intense parmi les supporters de l'Atlético, qui estiment que le VAR affecte négativement les performances de l'équipe. Pendant ce temps, le club continue de concourir avec la même intensité, cherchant à progresser dans la compétition malgré les polémiques. Les prochains matches de l'Atlético en Ligue des Champions seront cruciaux pour déterminer si l'équipe pourra surmonter la série de buts refusés et continuer à progresser en phase de groupes et au-delà.